Завязка сюжета начинается с того, что демон-лис с девятью хвостами появляется в окрестностях деревни. Чтобы победить его, свои усилия объединили многие ниндзя и ценой своих жизней сумели загнaть монстра в тело ребёнка. С этого и начался жизненный путь главного действующего лица Наруто, именем которого и названо аниме.
В маленькой деревне, населённого преимущественно ниндзями, есть соответствующая тренировочная школа. Наруто - ученик, обучающийся в данной школе, но далеко не самый успешный. Он уже провалился на выпускном экзамене. Наруто любить пошалить и поозорничать, чем доставляет немало хлопот окружающим, включая своего учителя Ируку Умино, который не всегда поддерживает и оправдываёт то, что делает Наруто, несмотря на то, что настроен к нему весьма понимающе и доброжелательно.
Больше всего Наруто желает Хокаге (лидером деревни).
После множества недоразуменей Наруто демонстрирует свои истинные способности, сразившись с очень сильным врагом и спася жизнь Ируке. Это засчитывается в качестве выпускного экзамена, и Наруто переходит на испытательный срок. Вместе с Саске Учихой и Сакурой Харуно Наруто начинает тренироваться под руководство Какаси Хатаке, который хотя и не выглядит агрессивным малым, а наоборот - расслабленным и ленивым, является очень могущественным ниндзей и довольно суровым учителем по отношению к своим ученикам.
Для разнообразия Наруто периодически продолжает становиться причиной всевозможных недоразмений, продолжая тем не менее путь к своей мечет - стать Хокаге
